La colección se encuentra distribuida en las tres salas, que guiarán al visitante hacia una magnífica visión de la fauna de La Venta, en el desierto de la Tatacoa duran el periodo del Mioceno: sala de mamíferos, sala de ambientes y sala de reptiles. Cuenta con aproximadamente 550 fósiles, se destacan las formaciones Honda y La Venta donde afloran estos vestigios del pasado. El museo se organizó en el año de 1985, producto de una rigurosa investigación por parte del Dr Carlos Villaroel (Paleontólogo) y Javier Guerrero (Geólogo), ha contado con el aporte e interés de la comunidad local y personas de instituciones públicas y religiosa. 

Está ubicado en la antigua Casa Cural de Villavieja al lado de la Capilla Doctrinera de Santa Bárbara (Patrimonio Cultural de La Nación), donde durante algún tiempo funcionara el hoy Museo Paleontológico de Villavieja "Más allá del Tiempo" renovado en su presentación y guión interpretativo