El crecimiento de la población a mediados de 1900, genera la necesidad de crear un nuevo hospital. En 1940 se adquiere el predio de (4990 m2); y dieciocho años después inicia la construcción del edificio de siete plantas y con capacidad para 350 camas. En 1975 fue puesto al servicio de la comunidad, 1976 abrió el servicio de urgencias y de hospitalización con 120 camas. 

El nombre del Hospital hace honor al Doctor Hernando Moncaleano Perdomo, director del anterior Hospital San Miguel. Actualmente presta los servicios de: Urgencias, Unidad de Cuidados Intensivos (UCI) Adultos, Unidad de Cuidados Intensivos (UCI) Neonatal y Pediátrica, Unidad de Cancerología, Servicio Quirúrgico, Apoyo Diagnóstico y Complementación Terapéutica, Consulta Externa Especializada, Servicio de Hospitalización, Medicina Cardiovascular, Cardiología Invasiva, Unidad de Trasplantes, Unidad de Neurofisiología, Servicio de Otorrinolaringología, Unidad de Urgencias Pediátricas, Tratamiento Especializado para Patología del Seno, Tratamiento Especializado en Oncología Pediátrica, Tratamiento Especializado para Glaucoma y Laboratorio Especializado de Inmunología. Irradiando beneficios a la región Surcombiana (Huila, sur del Tolima, Caquetá, parte del Amazonas, el Putumayo y parte del Cauca)